Учреждение структурных подразделений не имеет.
Коллегиальными органами управления Учреждения являются : Наблюдательный совет, Общее собрание, Педагогический совет
Положение о Наблюдательном совете
Положение о Педагогическом совете МАДОУ "Детский сад №39"
В целях учета мнения воспитанников, родителей (законных представителей) воспитанников и педагогических работников по вопросам управления Учреждением и при принятии локальных нормативных актов, затрагивающих их права и законные интересы, по инициативе родителей (законных представителей) воспитанников и педагогических работников в Учреждении создан Совет родителей (законных представителей) воспитанников.